Show description

L’isomérisation spontanée de la liaison X-Pro est lente en raison du caractère de double liaison partielle de cette dernière et elle serait une étape limitante du reploiement des chaînes polypeptidiques si, in vivo, elle n’était accélérée par des peptidyl prolyl isomérases qui déforment la liaison peptidique de telle façon que les atomes C, O, et N ne soient plus coplanaires et que la barrière d’activation soit abaissée. De plus, la formation de liaisons disulfure correctes dans les protéines naissantes est accélérée, in vivo, par la disulfure isomérase, enzyme de large spécificité pour des substrats contenant des résidus cystéine.

On a alors proposé un usage plus large du terme allostérie, qui inclut les idées d’équilibre entre des formes macromoléculaires et d’influence d’un ligand sur ces équilibres. Des équations d’interactions décrivant l’effet de la concentration du ligand sur le rapport des différentes conformations ont été établies et deux modèles spécifiques, le modèle concerté et le modèle séquentiel, ont été décrits. MODÈLE CONCERTÉ Le modèle concerté ou modèle MWC (Monod, Wyman, Changeux) est fondé sur l’équilibre entre deux formes macromoléculaires : T (de tense, tendue, contrainte par l’association des sous-unités entre elles) et R (de relaxed, relâchée) ; il contient l’essence même de la manière dont une fonction peut être exprimée en termes de changements structuraux.

3B). La structure en double hélice du DNA suggère comment l’information génétique est stockée et répliquée (p. 341). 3C) ; ces derniers sont de deux types caractérisés par leur largeur : le grand sillon, de 12 Å de large, et le petit sillon, de 6 Å de large. La largeur différente des sillons reflète l’asymétrie de la liaison des paires de bases aux cycles des désoxyriboses. Le petit sillon contient le O-2 d’une pyrimidine et le N-3 d’une purine d’une paire de bases ; le grand sillon se situe sur le côté opposé de la paire.